El protocolo de extracción comienza colocando los consumibles y reactivos dentro del equipo. Se selecciona el protocolo de interés y se corre el protocolo, cuya duración promedio es de 1.5 – 2 horas, dependiendo del número de muestras, el ácido nucleico y el kit.
Los consumibles del equipo constan únicamente del recambio de columnas, los consumibles y reactivos correspondientes al kit de extracción seleccionados (búfer de lisis, lavado, elución). Su mantenimiento es sencillo y constante conforme al uso de este.